随着西葫芦种植面积的扩大，西葫芦种子产业迎来了机遇。但由于制种程序不规范，使各地同一种性壮差异很大。因此规范西葫芦制种程序很有必要。笔者认为该种子质量的程序控制可分为：自交系、播种及苗情、授粉标记、采收、加工和销售等质量的程序控制。
授粉标记质量控制
授粉前
应根据瓜胎的形状、颜色及植株长势，再一次杂，同时将母本上的雄花和第1雌花及父本上的雌花全部人工去掉，以确保母本第2～3朵雌花及父本花粉的质量。
授粉、标记
于前1天下午将第2天即将开放的母本的雌花及父本的雄花全部套袋。第2天清晨将父本雄花先收集起来。去除花冠，用雄蕊在母本柱头上轻轻均匀涂抹授粉，即刻中应注意：发现有畸形瓜则及时去掉，以利杂交瓜发育；凡已做杂交的瓜如发现未套袋应去掉；已做的杂交瓜套袋完整，而未做标记，应既是做好标记；制种授粉全部结束后，应拔除父本植株。